Ostatnia rzecz, o której często się zapomina, to jakość wody w długim okresie. Deszczówka, mimo filtracji, może zawierać bakterie i glony, które tworzą biofilm na ściankach rurek. Dlatego co sezon należy przeprowadzić dezynfekcję instalacji – najlepiej preparatem na bazie nadtlenku wodoru, który nie niszczy tworzywa. Przy projektowaniu uwzględnij zawory spustowe w najniższych punktach, aby móc opróżnić system na zimę, jeśli nie będziesz go używać. Zimą, gdy woda zamarza, maty pękają, więc jeśli zbiornik nie jest ogrzewany, musisz zabezpieczyć instalację przed mrozem.